- 第1天 代谢组基本原理与方法
- 1.代谢组背景知识（色谱、质谱）
- 2.代谢组原理与概念（非靶、靶向、广靶）
- 3.脂质组原理与概念（脂质结构、相对定量、绝对定量）
- 第2天 代谢样品的前处理与上机
- 1.代谢组样品的取样与保存
- 2.代谢组样品的前处理
- 3.代谢组样品检测方法的建立
- 4.脂质组样品的前处理与检测方法建立
- 第3天 本地标准品数据库的建立
- 1.本地标准品数据库的建立方法实操
- 2.代谢物分类、结构识别与结构绘制
- 3.代谢物ID转换及分子量计算
- 4.代谢物通路注释
- 5.MSP格式文件的解读与编辑
- 6.代谢组数据的上传与下载
- 第4天 公共代谢数据库的介绍与使用
- 1.Metlin数据库的使用与下载
- 2.HMDB、MassBank、Pubchem、MONA、Chemspider、NIST等数据库
- 3.代谢通路数据库BioCyc与反应途径数据库Reactome的使用
- 4.脂质组数据库LIPID MAPS及LIPID Blast的使用
- 5.其他代谢数据库的使用（药物数据库Drugbank、中药数据库OTCML、食物数据库Foodb、毒物数据库T3db等）
- 第5天 代谢组下机数据预处理
- 1.代谢组(脂质组)分析流程介绍
- 2.不同质谱仪下机数据格式转换（ProteoWizard的使用）
- 3.XCMS软件的使用
- 4.MZmine的使用
- 5.代谢组离群值及缺失值处理
- 6.代谢组标准化、中心化与标度化
- 第6天 代谢组物质鉴定与统计分析
- 1.代谢物鉴定的原理
- 2.代谢物鉴定方法与实操
- 3.MSDIAL软件分析实操（LC-MS、GC-MS、代谢组及脂质组）
- 4.MetDNA在线分析代谢组实操(基于代谢网络分析非靶代谢组)
- 5.差异代谢物统计分析
- 6.MetaboAnalyst的使用
- 第7天 代谢组数据可视化
- 1.代谢组相关性分析及可视化
- 2.云图分析、聚类热图、火山图
- 3.差异代谢物KEGG富集分析
- 4.差异脂质富集分析（链长及饱和度）
- 5.代谢网络分析与Cytoscape网络可视化
- 第8天 代谢组多元变量统计
- 1.PCA模型的建立与解读
- 2.PLS-DA模型的建立与解读
- 3.OPLS-DA模型的建立与解读
- 4.O2PLS模型在关联分析中的应用
- 第9天 代谢组与其他组学关联分析
- 1.鼠小弟云分析平台的使用
- 2.转录组与代谢组关联分析
- 3.基因组与代谢组关联分析（mGWAS）
- 第10天 代谢组学文章解读与方案设计
- 1.代谢组学及脂质组学不同档次文章思路解读
- 2.代谢组学及脂质组学实验方案设计指导
- 3.代谢组及脂质组学分析心得交流、资料共享与课程总结
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