- 第1天 R语言基础
- 1. R和Rstudio安装
- 2. R包安装
- 3. R基本语法
- 4. ggplot2绘图包介绍
- 第2天 单细胞研究技术背景
- 1. 单细胞转录组技术简介
- 2. 单细胞免疫组库简介
- 3. CellRanger使用介绍
- 4. GEO公共数据下载介绍
- 第3-4天 Seurat细胞分群分析
- 1. Seurat细胞分群（案例解读）
- 2. 双细胞去除
- 3. 读入counts数据
- 4. 过滤和质控
- 5. 多样本整合分析
- 6. 细胞marker鉴定
- 7. 细胞注释策略详解
- 8. 组间差异比较分析
- 9. 基因功能富集分析
- 第5天 Monocle拟时分析
- 1. monocle拟时分析（轨迹推断，案例解读）
- 2. 基因选择
- 3. 降维
- 4. 细胞排序
- 5. 拟时相关基因鉴定
- 第6-7天 scVelo单细胞速率分析
- 1. scvelo单细胞速率分析介绍（轨迹推断，案例解读）
- 2. python3基础知识
- 3. velocyto分析非剪切与剪切counts
- 4. scvelo分析
- 第8-9天 CellChat细胞互作分析
- 1. CellChat细胞互作分析（案例解读）
- 2. 单一数据集分析
- 3. 多数据集差异分析（相同细胞构成）
- 4. 细胞排序
- 5. 多数据集差异分析（不同细胞构成）
- 第10天 SCENIC转录因子调控网络分析
- 1. SCENIC转录因子分析（案例解读）
- 2. 共表达网络推断
- 3. 转录因子结合motif分析
- 4. 细胞调控网络活性得分
- 第11天 Immunarch单细胞免疫组库分析
- 1. immunarch免疫组库分析（案例解读）
- 2. 免疫组库重复分析
- 3. VDJ基因使用分析
- 4. 多样性分析
- 5. 克隆型追踪
- 6. motif分析
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关注人数
782
学员人数
10
课程数目
16
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1.直播期间，学员可以在屏幕上提问，主要是以文字形式提问，讲师会及时解答学员的问题。
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